Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms