Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM12Q9H4Q4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM12Q9H4Q4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms