Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00597Q9H2U6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms