Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP62CLQ9H1M0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP62CLQ9H1M0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms