Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD1Q9GZZ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms