Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms