Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms