Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NLRP1Q9C000 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NLRP1Q9C000 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms