Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms