Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP4Q9BWG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP4Q9BWG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms