Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
REPIN1Q9BWE0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms