Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms