Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TM2D3Q9BRN9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM2D3Q9BRN9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms