Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FYCO1Q9BQS8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms