Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPIN3Q9BQK8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms