Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms