Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY1Q96T51 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms