Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM209Q96SK2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms