Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R9BQ96SB3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms