Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A2Q96QD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A2Q96QD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms