Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMG1Q96Q15 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMG1Q96Q15 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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