Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms