Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOX2Q96NM4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms