Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG8Q96MW5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG8Q96MW5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms