Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms