Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms