Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms