Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms