Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR1Q96JP9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR1Q96JP9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms