Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAMP1Q96JM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAMP1Q96JM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms