Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
COG3Q96JB2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms