Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG1Q96JA1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms