Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC12Q96J65 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC12Q96J65 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms