Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22AQ96IW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms