Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms