Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms