Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms