Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
RUNDC1Q96C34 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms