Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYTL4Q96C24 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms