Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD2Q96BF3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms