Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHMTQ93088 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms