Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRG4Q92954 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PRG4Q92954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms