Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFAP3Q92845 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFAP3Q92845 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFAP3Q92845 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms