Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRUQ92729 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRUQ92729 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms