Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCSTNQ92542 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCSTNQ92542 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms