Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3CQ92520 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms