Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPDL3AQ92484 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms