Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms