Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSH3Q8TE77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms