Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HELQQ8TDG4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms